Virus Shamonda : définition, impact sur le bétail et cas humain inattendu

Une personne décédée au début du mois d’octobre dans la ville de Lyon a été dépistée positive au virus Shamonda. Il s’agit de la première détection de ce virus chez l’humain. Le virus Shamonda affecte principalement le bétail bovin, selon le Ministère de l’Agriculture, de la Pêche et de l’Alimentation d’Espagne.

Qu’est-ce que le virus Shamonda ?

« Le virus Shamonda appartient au genre Orthobunyavirus, et est principalement transmis par des diptères (moustiques piqueurs) du genre Culicoides ». Selon le ministère espagnol de l’Agriculture, le virus Shamonda a été détecté pour la première fois au Nigeria au milieu des années 1960. « Jusqu’en 2026, il avait été signalé de manière sporadique dans diverses régions d’Afrique occidentale, orientale et méridionale, ainsi qu’au Japon. Au cours de l’été 2026, le virus a été détecté pour la première fois en Europe centrale, une variante nommée Shamonda-Europe a été identifiée ». Selon l’Université de Murcie, ce virus de type 1 a également été détecté dans des élevages bovins de Cordoue et de Tolède. On estime que le virus se transmet entre animaux par les piqûres de moustiques.

Première personne affectée dans le monde

Le Ministère de l’Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire du pays a informé que la personne infectée par le virus Shamonda présentait une immunodépression grave et affirme qu’avec les informations disponibles à ce jour, il n’existe pas de risque pour la santé publique pour la population générale.

Selon un communiqué du ministère, jusqu’à présent on ne considérait pas que le virus Shamonda puisse se transmettre aux personnes. « L’infection par le virus Shamonda chez ce patient constitue, par conséquent, la première détection documentée et notifiée de ce virus chez l’être humain », ajoutent-ils.

L’hypothèse actuellement explorée dans les recherches est que l’infection du patient résulte d’une transmission vectorielle, c’est-à-dire par la piqûre d’un moustique du genre Culicoides dans l’est de la France, une zone où la circulation du virus chez les animaux a été signalée au printemps et à l’été 2026. Néanmoins, on ignore comment le patient a contracté l’infection virale et si cela a été la cause directe du décès.

Santé mondialisée

Comme l’a indiqué David Roiz, du Institut de Recherche en Ressources Cynégétiques (IREC), de l’Université de Castilla-La Mancha, dans des déclarations à SMC Espagne, « il n’y a aucun risque pour la population générale puisqu’il s’agit d’un cas chez un patient immunodéprimé, et c’est une nouveauté pour ce virus, mais ce n’est pas si étrange. Il existe de nombreux bunyavirus circulant naturellement entre les mammifères dans les zones tropicales et qui provoquent des cas sporadiques chez l’humain. Dans un monde globalisé, où circulent des animaux, des marchandises et où le climat évolue, il n’est pas rare que des cas de transmission humaine se produisent et il ne faut pas s’alarmer, mais simplement rester vigilants et proactifs face aux risques sanitaires potentiels ».

Dans ce sens, Ben Brennan, chef de groupe et professeur titulaire du Centre de Recherche Virologique du MRC et de l’Université de Glasgow, ajoute que « détecter un virus chez un patient présentant un système immunitaire gravement compromis ne signifie pas nécessairement qu’il représente un risque significatif pour des personnes autrement en bonne santé. À l’heure actuelle, il n’existe pas de preuves que le virus Shamonda provoque une maladie généralisée chez l’homme, bien que des recherches supplémentaires soient nécessaires pour comprendre sa capacité d’infecter les personnes ».

Les autorités françaises ont communiqué ce premier cas à l’Organisation Mondiale de la Santé et au Centre européen de contrôle et de prévention des maladies, conformément aux procédures en vigueur dans de tels cas.

À quels animaux cela touche-t-il ?

Le bétail bovin, après la piqûre du moustique, est considéré comme l’hôte du virus et peut donc être infecté et développer la maladie. Selon les autorités, le bétail ovin et caprin sont également susceptibles d’être infectés.

Ce moustique, (Culicoides), participe aussi à la transmission d’autres virus chez les animaux, comme la maladie de la langue bleue, la maladie hémorragique épizootique ou la peste équine africaine. Il n’existe pas de preuves d’une transmission directe significative entre les animaux, bien qu’il ait été décrit la possibilité d’une transmission verticale de la mère au fœtus pendant la gestation.

Chez le bétail, les infections aiguës peuvent principalement provoquer de la fièvre, ainsi qu’une diminution de la production de lait entre 10 et 20 % pendant une semaine à dix jours, en plus de diarrhée.

Mónica González Candela, professeure titulaire au département de Santé animale de la faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Murcie, a expliqué à SMC Espagne que « pour l’instant, je pense qu’il ne faut pas s’alarmer et que l’objectif immédiat est de renforcer la vigilance intégrée entre médecins, vétérinaires, biologistes et entomologists avec une approche One Health ». Selon González, dans la population générale, il faut toujours prendre des précautions vis-à-vis des maladies transmises par les moustiques. « Si vous vous rendez dans un endroit où il y a des moustiques, il faut utiliser un répulsif, couvrir la peau et éviter les heures où les moustiques sont les plus actifs ». Par conséquent, l’experte conseille d’accorder une attention particulière aux lieux où coexistent des vecteurs comme les moustiques ou les tiques et de consulter un médecin en cas de symptômes après une morsure.

Transmission par l’alimentation

Selon le Ministère de l’Agriculture français, « jusqu’à présent, aucune donnée scientifique disponible ne documente la transmission du virus Shamonda par la consommation de viande, de lait ou de produits dérivés. De plus, les produits issus d’animaux malades restent exclués de la consommation ».