Malena García Arredondo, spécialiste du système digestif, sur le microbiote intestinal : l’alimentation compte autant que l’antibiotique

Lorsque le froid et les rhumes arrivent, les infections respiratoires et la vie hivernale s’imposent, il arrive parfois que nous ayons besoin de prendre des antibiotiques. Vaut-il mieux préciser que ces médicaments doivent être pris uniquement sur ordonnance d’un médecin. C’est à ce moment-là que la crainte peut surgir, celle que ce traitement nuise à notre microbiote intestinal.

Ce microbiote est constitué d’une multitude de micro-organismes qui influent fortement sur la santé de l’ensemble du système digestif. Selon ce qu’explique à CuídatePlus Malena García Arredondo, spécialiste de l’appareil digestif et directrice MGA Healthy Digest, le microbiote comprend “les bactéries intestinales qui participent au maintien de la barrière intestinale, à la régulation du système immunitaire et à la production de substances bénéfiques, telles que les acides gras à chaîne courte. De plus, un microbiote équilibré complique la prolifération de micro-organismes potentiellement pathogènes.”

Antibiotiques et microbiote: comment cela impacte-t-il ?

Il peut sembler que tous les antibiotiques endommagent quelque peu le microbiote. Or García Arredondo souligne que l’impact n’est pas identique pour tous. “L’impact dépend du type et du spectre de l’antibiotique, de la durée du traitement et aussi de la microbiote de départ de chaque personne. Certaines bactéries diminuent et d’autres, plus résistantes, peuvent profiter de ce changement pour proliférer.”

La spécialiste rappelle que le microbiote se caractérise par une capacité de récupération très importante, même si certains changements peuvent persister pendant des semaines ou des mois et ne reviennent pas nécessairement à leur composition initiale. Ce qui importe, selon l’experte, n’est pas seulement de perdre la diversité des bactéries, mais les fonctions du microbiote. Un autre aspect clé est que les antibiotiques peuvent sélectionner des bactéries résistantes et modifier ce qu’on appelle le resistome intestinal, c’est-à-dire l’ensemble des gènes de résistance aux antibiotiques présents dans notre microbiote.

(Foto: Magnific)

Que faire lorsque survient la diarrhée ?

Certains antibiotiques peuvent favoriser l’apparition de diarrhée. À ce sujet, García Arredondo indique que les probiotiques “peuvent être un outil utile, surtout pour prévenir ou diminuer cet effet. Mais il faut les choisir avec soin, car leurs effets dépendent de la souche et de la situation clinique. Plutôt que de les utiliser de manière indiscriminée, l’important est de personnaliser leur indication et de les accompagner d’une alimentation qui favorise la récupération du microbiote”.

Que manger pendant que nous prenons des antibiotiques ?

Une étude publiée dans la revue médicale Nature indiquait que consommer des sucreries pendant un traitement antibiotique peut contribuer à un dommage plus important de l’intestin. García Arredondo précise que cette recherche “met sur la table une idée relativement nouvelle : ce n’est pas seulement quel antibiotique nous prenons qui compte, mais aussi ce que nous mangeons pendant que nous le prenons”.

Selon l’experte, prendre des antibiotiques modifie temporairement le microbiote intestinal. “À ce moment-là, une disponibilité accrue de sucres simples peut favoriser que certaines bactéries opportunistes occupent cet espace. L’étude a notamment observé une expansion d’Enterococcus faecium”. Néanmoins, cette étude présente certaines limites, et bien que ses résultats ne puissent pas être généralisés à l’ensemble de la population, “elle renforce la recommandation de limiter les sucres libres et les aliments ultratransformés pendant un traitement antibiotique”.

Pistes pour récupérer le microbiote

Si le microbiote souffre après la prise d’un antibiotique, García Arredondo rappelle qu’il ne s’agit pas de remplacer les bactéries qui ont été affectées, mais de “créer les conditions pour que notre propre microbiote se rétablisse”.

La spécialiste donne quelques clés pour nourrir les bactéries qui survivent après la prise d’un antibiotique. “La clé ne réside pas dans un aliment précis, mais dans la diversité alimentaire” :

• Alimentation variée et riche en fibres : légumes, fruits entiers, légumineuses, céréales complètes, fruits à coque et graines.

• Aliments riches en polyphénols.
• Aliments fermentés, comme le yaourt ou le kéfir, à condition qu’ils soient bien tolérés.

Néanmoins, il n’est pas nécessaire d’attendre la fin d’un traitement antibiotique pour prendre soin du microbiote. García Arredondo recommande donc, lorsque c’est tolérable, de maintenir un mode d’alimentation méditerranéen incluant “légumes, fruits entiers, légumineuses, céréales complètes, fruits à coque et huile d’olive extra vierge”.

Il convient de préciser que réduire les sucres simples ne signifie pas supprimer les fruits ni les glucides. Un fruit entier, riche en fibres et en polyphénols, n’a pas le même effet qu’un soda ou qu’une friandise.

Alimentation et antibiotiques

Il ne faut pas attendre de devoir prendre un antibiotique pour se rappeler qu’il faut prendre soin du microbiote intestinal. Et il ne faut pas non plus attendre d’avoir terminé le traitement. García Arredondo rappelle que “précisément pendant ces jours, l’écosystème intestinal est particulièrement vulnérable.” Par conséquent, l’experte conseille de suivre ces principes d’un régime méditerranéen. Toutefois, “si la diarrhée, les ballonnements ou une sensibilité digestive ont été présents, la fibre doit être augmentée progressivement selon la tolérance”.

Si notre estomac est particulièrement sensible après l’antibiotique, García Arredondo rappelle qu’“il n’est pas nécessaire de suivre un régime détox. Le microbiote est un écosystème et les écosystèmes ont besoin de diversité et de temps pour récupérer.”