Coronavirus : actualités et prévention du COVID-19
Qu’est-ce que c’est
Les coronavirus constituent la famille de virus à laquelle appartient le SARS-CoV-2, responsable de la pandémie de Covid-19. Ils ont été découverts dans les années 60, mais leur origine demeure inconnue. Leurs différentes formes provoquent diverses maladies, allant d’un simple rhume à un tableau respiratoire grave (une forme sévère de pneumonie).
Une grande part des coronavirus ne sont pas dangereux et, au pire, entraînent des symptômes légers. En fait, la plupart des personnes contractent un coronavirus à un moment donné de leur vie, généralement pendant l’enfance. Bien qu’ils soient plus fréquents à l’automne ou en hiver, on peut les contracter à n’importe quel moment de l’année.
Le nom coronavirus vient de son apparence, semblable à une couronne ou à un halo. Il s’agit d’un type de virus présent surtout chez les animaux, mais également chez l’être humain.
Au cours des dernières années, trois épidémies majeures dues à de nouveaux coronavirus ont été décrites :
Covid-19/ SARS-CoV-2: À la fin du mois de décembre 2019, les premiers cas d’un nouveau coronavirus ont été signalés dans la ville de Wuhan (Chine). Depuis lors, l’augmentation des personnes infectées par le virus SARS-CoV-2 (initialement appelé 2019-nCoV), qui provoque la maladie nommée Covid-19, a été continue et sa transmission interhumaine s’est accélérée. Les cas officiellement déclarés dépassent largement ceux de l’épidémie de SRAS de 2002-2003. Son taux de létalité est inférieur à celui d’autres coronavirus, mais un nombre beaucoup plus élevé de décès est enregistré en raison du fait qu’un vaste pourcentage d’individus présentent des symptômes graves et que les personnes infectées se comptent par centaines de millions dans le monde (plus de 500 millions fin avril 2022). Des études estiment que la mortalité causée par le nouveau coronavirus est bien supérieure à celle reflétée par les chiffres officiels.
L’Organisation mondiale de la Santé (OMS) a déclaré en 2020 l’état de pandémie. Il existe des cas sur toute la planète et les professionnels de la santé insistent sur la nécessité de suivre les mesures préventives et de contrôle.
En Espagne, l’état d’alerte a été décrété et, après une période de confinement, on est entré dans la fameuse « nouvelle normalité ». Cependant, les cas ont rapidement recommencé à augmenter et plusieurs vagues d’infections ont été enregistrées. Certaines restrictions restent en vigueur, comme le port du masque dans les établissements de santé et les transports publics.
De nombreux vaccins ont été développés et approuvés contre le SARS-CoV-2 et le taux de vaccination de la population mondiale a atteint des chiffres très élevés dans plusieurs pays, tandis que dans d’autres pays il reste clairement insuffisant. Fin avril 2022, le taux de vaccination avec un schéma complet se situe à plus de 85 % de la population en Espagne. L’Agence européenne des médicaments (EMA) a approuvé le 30 mars 2023 le vaccin espagnol Hipra comme dose de rappel.
Plusieurs variantes du virus sont apparues et l’OMS a désigné par des lettres grecques celles qui présentent un caractère préoccupant : α (alpha), β (bêta), γ (gamma), δ (delta) et ο (omicron). Actuellement, seules les deux dernières circulent.
L’OMS a déclaré le 5 mai 2023 la fin de l’urgence de santé publique de portée internationale. Néanmoins, le directeur général, Tedros Adhanom Ghebreyesus, a souligné que cela ne signifie pas que la Covid-19 ait cessé d’être une menace pour la santé mondiale.
SARS-CoV-1: Le syndrome respiratoire aigu et grave (SRAS, également connu sous SRAS et SRAG) est apparu en novembre 2002 en Chine, a touché plus de 8 000 personnes dans 37 pays et a provoqué plus de 700 décès. La mortalité du SRAS-CoV est estimée à environ 10 %.
MERS-CoV: Le coronavirus responsable du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) a été détecté pour la première fois en 2012 en Arabie saoudite. Jusqu’en octobre 2019, plus de 2 400 cas d’infection ont été signalés dans divers pays, avec plus de 800 morts. La létalité est donc d’environ 35 %.
Causes
Il y a quelques années, les coronavirus se transmettaient de manière limitée entre humains. On ignore l’origine de ces virus, mais on sait que certains animaux, comme les chauves-souris, agissent comme réservoirs.
Comme pour d’autres virus susceptibles de provoquer une pneumonie, la contagion chez l’humain se fait généralement par voie respiratoire, à travers les gouttelettes et les aérosols que les personnes émettent lorsqu’elles toussent, éternuent ou parlent.
Tout porte à croire que le nouveau coronavirus à l’origine de la Covid-19 a aussi une origine animale. En effet, les premiers cas ont été liés à un marché d’animaux vivants à Wuhan, en Chine. L’OMS a appelé à surveiller les infections chez les animaux sauvages afin d’éviter que ces bêtes ne deviennent des réservoirs du SARS-CoV-2.
Concernant le MERS, il est probable que les chameaux constituent un réservoir important pour ce type de coronavirus et une source animale d’infection chez l’humain, comme l’indiquait l’Organisation mondiale de la Santé dans sa note descriptive sur la maladie. Cependant, la fonction exacte des chameaux dans la transmission du virus et les routes de transmission restent inconnues.
À l’origine, le coronavirus MERS-CoV est un virus zoonotique qui se transmet d’animaux à l’humain. D’après l’analyse de plusieurs de ses génomes, on pense que le virus est né chez les chauves-souris et aurait été transmis ensuite aux chameaux dans un lointain passé.
On pense que le coronavirus du premier SRAS a pris naissance chez les chauves-souris, passant ensuite à une autre espèce de petit mammifère, comme la civette, puis finalement aux humains.
Symptômes
En général, les symptômes principaux des infections par coronavirus peuvent être les suivants. Ils dépendent du type de coronavirus et de la gravité de l’infection :
- Toux.
- Fatigue, asthénie.
- Fièvre.
- Perte du goût et de l’odorat.
- Mal de gorge.
- Difficulté à respirer (dyspnée).
- Douleurs à la tête.
- Manifestations cutanées telles que des engelures sur les mains et les pieds (surtout chez les enfants et les adolescents), urticaire avec ou sans démangeaisons ou érythème polymorphe.
- Modifications au niveau des paumes des mains et des plantes des pieds. Elles se caractérisent par une sensation de brûlure et des rougeurs qui peuvent parfois entraîner une desquamation ou l’apparition de taches caractéristiques.
- Frissons et mal être général.
- Obstruction nasale, écoulement et rhinorrhée.
- Problèmes d’expression (parler).
- Difficultés à se mouvoir.
- Douleur musculaire (myalgies).
- Langue Covid: augmentation de la taille de la langue et d’autres lésions linguales, comme des zones dépapillées – plus lisses – et, par conséquent, des indentations sur le bord de la langue.
- Diarrhée.
Le spectre clinique de ce type d’infections varie de l’absence de symptômes à des symptômes respiratoires légers ou graves. Cette typologie se manifeste généralement par toux, fièvre et difficultés respiratoires. Une pneumonie est souvent présente et, dans le cas du MERS, des symptômes gastro-intestinaux, notamment diarrhée, peuvent aussi être observés.
Comme pour le virus de la , les formes les plus graves (et la mortalité la plus élevée) se rencontrent chez les personnes âgées ou chez celles présentant une immunodépression ou des maladies chroniques telles que diabète, certains types de cancer ou une maladie pulmonaire chronique. Dans les cas les plus graves, une insuffisance respiratoire peut survenir.
Lors de la pandémie de Covid-19, il a été constaté qu’un pourcentage très élevé de personnes infectées présentent des symptômes légers ou sont asymptomatiques. Même ces dernières peuvent transmettre le virus, ce qui est l’une des raisons de la grande expansion de l’épidémie.
Prévention
Des vaccins existent pour prévenir l’infection par le coronavirus SARS-CoV-2, et leur administration a commencé chez les populations les plus exposées à la fin de 2020. Les premières vaccinations commercialisées en Europe furent celles de Université d’Oxford-AstraZeneca, Pfizer-BioNTech et Moderna, suivies de celle de Janssen. Le vaccin espagnol Hipra, approuvé fin mars 2023, est recommandé comme dose de rappel à partir de 16 ans chez les personnes ayant déjà reçu un vaccin à base d’ARN messager.
Outre le développement de médicaments et de vaccins, comprendre comment se transmet un agent pathogène est fondamental pour établir des mesures préventives. Les coronavirus se transmettent par voie aérienne. Ils se propagent par voie respiratoire via les gouttelettes produites par les porteurs lorsqu’ils toussent, éternuent ou parlent. Des preuves croissantes indiquent aussi une transmission aérienne par des aérosols du nouveau coronavirus.
Les sécrétions contiennent des particules virales qui peuvent atteindre des personnes à proximité ou se déposer sur des objets et des surfaces environnantes. Si quelqu’un touche ces surfaces puis porte ses mains à ses yeux, son nez ou sa bouche, le pathogène peut entrer dans l’organisme.
Il a été démontré que le SARS-CoV-2 peut survivre sur diverses surfaces pendant plusieurs heures (cuivre, carton) et même quelques jours sur certains matériaux (plastique, acier inoxydable). Toutefois, la quantité de virus viable diminue avec le temps et n’est pas toujours présente en quantité suffisante pour provoquer une infection.
Avec le temps, on a constaté que les contaminations par contact avec des surfaces contiennent le virus de manière très rare, alors que celles dues à l’action des aérosols sont majoritaires.
Les personnes infectées par le virus responsable de Covid-19 devaient initialement observer une quarantaine de 14 jours, mais cette période a été raccourcie au fur et à mesure de l’évolution de la pandémie. Différents délais d’isolement et de quarantaine ont été instaurés selon qu’il s’agissait d’un cas confirmé, d’un cas probable ou d’un contact étroit. Plus récemment, on a mis fin à l’isolement des cas légers et asymptomatiques et les tests diagnostiques ont été moins systématiquement réalisés. À présent, les tests se concentrent sur les personnes de plus de 60 ans, les personnes immunodéprimées et les femmes enceintes, ainsi que sur les environnements vulnérables (soins de santé et secteurs médico-sociaux) et les cas graves, pour lesquels la surveillance sera focalisée.
Les recommandations concernant le port du masque ont aussi évolué en fonction de la situation épidémiologique. Initialement recommandée uniquement pour les personnes infectées, son usage est ensuite devenu obligatoire de manière générale dans les espaces publics extérieurs et intérieurs. Aujourd’hui, de nombreux pays ont abandonné l’obligation, et en Espagne, le port du masque est restreint à certains espaces clos (principalement les centres de santé, les maisons de retraite et les transports publics) à partir du 20 avril 2022.
Les mesures préventives protègent particulièrement les personnes âgées et celles souffrant de diabète, d’insuffisance rénale, de broncho-pneumopathie chronique ou d’immunodépression, car elles présentent un risque plus élevé de développer une maladie grave en cas d’infection par le coronavirus.
Types
Chez les coronavirus humains, la gravité peut varier de manière significative selon le type :
Coronavirus du rhume
Cette variante de coronavirus correspond aux types 229E et OC43, qui provoquent les symptômes typiques d’un rhume, bien que, dans les cas les plus graves, ils puissent aussi occasionner une pneumonie chez les personnes âgées ou chez les nouveau-nés.
Les types de coronavirus 229E et OC43 provoquent les symptômes typiques d’un rhume.
Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS)
Il s’agit d’une forme grave de pneumonie. Il provoque des difficultés respiratoires et une fièvre supérieure à 38 °C. L’épidémie de 2002 s’est propagée à travers le monde, même si sa fréquence a toujours été plus élevée en Asie de l’Est.
Syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV)
Il provoque de graves troubles respiratoires, en plus de fièvre, toux et difficulté à respirer, bien qu’il puisse être asymptomatique au départ. Dans les cas les plus graves, on observe aussi des expectorations sanglantes, de la diarrhée et des vomissements. Le premier foyer remonte à 2012 et de nombreux cas ont été signalés au Moyen-Orient, mais il a aussi atteint l’Europe et les États-Unis.
Coronavirus de la Covid-19
Le nouveau coronavirus, nommé SARS-CoV-2 et détecté fin 2019 en Chine, présente une séquence génétique qui coïncide avec celle du SARS-CoV-1 à environ 80 %. Sa transmission a été beaucoup plus élevée, il a provoqué des maladies graves chez une grande partie de la population mondiale et le nombre de décès a été bien plus élevé.
Diagnostics
Pour déterminer la présence d’une infection par coronavirus, les médecins peuvent prélever une écouvillon naso-pharyngé ou du sang. Il existe différents tests de diagnostic du coronavirus. Les plus utilisés ont été la PCR et les tests antigéniques.
En cas de suspicion de coronavirus, on réalise généralement une tomodensitométrie (radiographie) thoracique pour évaluer les signes de pneumonie, ainsi que d’autres analyses de coagulation sanguine, une analyse biochimique et un bilan sanguin. Des tests sérologiques (anticorps) peuvent aussi être réalisés.
Par ailleurs, afin de contenir la transmission, une évaluation est effectuée chez les personnes présentant les symptômes et susceptibles d’être atteintes du virus.
Le contrôle de la température (par caméras thermiques et thermomètres numériques) des personnes arrivant dans un aéroport en provenance de zones affectées a été l’une des premières mesures mises en place pour détecter d’éventuels cas de Covid-19, comme cela a été fait pour les épidémies précédentes. Des questionnaires sont également adressés aux voyageurs; en cas de suspicion, ils font l’objet d’une évaluation et, le cas échéant, sont dirigés vers des centres de santé.
Au fil de l’évolution de la pandémie, de nouvelles formes de détection et de diagnostic de la maladie ont été introduites.
Traitements
Il n’existe aucun traitement spécifique contre le SARS-CoV-2, mais de nombreux médicaments font l’objet de recherches, seuls ou en association, ainsi que l’emploi de plasma de patients rétablis. Parmi les médicaments étudiés et parfois administrés dans le cadre d’essais cliniques ou de l’usage compassionnel, on trouve :
Remdésivir
C’est un médicament antiviral initialement développé pour traiter la maladie causée par le virus de l’Ebolae, mais qui a aussi montré une activité in vitro contre le SARS-CoV-2. Cependant, les résultats de ce traitement n’ont pas été aussi satisfaisants que prévu.
Ritonavir/ lopinavir
Il s’agit d’une association couramment utilisée contre le VIH. Le lopinavir inhibe certaines enzymes impliquées dans le cycle de réplication du virus, tandis que le ritonavir agit comme protecteur du lopinavir étant donné sa rapide dégradation.
Hydroxychloroquine
L’usage de l’hydroxychloroquine contre le nouveau coronavirus a été très controversé. L’ANSM (Agence européenne des médicaments) indique que ce médicament « a montré une efficacité contre le SARS-CoV-2 dans des études in vitro, mais il n’existe pas encore de preuves solides de son efficacité contre la Covid-19 chez l’humain ».
Dexaméthasone
La dexaméthasone est un corticoïde qui apparaît comme une option pour les patients les plus gravement atteints de Covid-19, car il pourrait réduire la mortalité.
Ivermectine
Un autre médicament qui a suscité beaucoup d’espoirs est l’ivermectine. Une étude récemment publiée dans le New England Journal of Medicine montre que son administration chez des patients en phase précoce ne réduit pas les probabilités d’hospitalisation en raison d’un éventuel dégradation de l’état.
En cas d’infection par les coronavirus SARS-CoV-1, MERS-CoV et SARS-CoV-2, l’admission à l’hôpital est souvent indiquée dans les cas graves. Si cela est jugé nécessaire par les médecins, des antiviraux et d’autres médicaments permettant de réduire l’inflammation pulmonaire et d’autres complications sont administrés, ainsi qu’un soutien respiratoire par oxygène ou une respiration assistée; des antibiotiques peuvent être utilisés occasionnellement, mais uniquement en cas d’infections bactériennes associées (superinfections).
Les composés cités s’associent à d’autres substances anti-inflammatoires ou antivirales, ainsi qu’à des antibiotiques (pour traiter ou prévenir les infections bactériennes secondaires) et à des inhibiteurs des cytoquinas.
En ce qui concerne le traitement des infections dues aux coronavirus du rhume, les cas sont généralement légers et se résolvent en suivant les mêmes mesures que pour un simple rhume. Il n’est pas fréquent que l’infection par ces coronavirus nécessite une intervention médicale et la simple repos et une hydratation suffisante suffisent à faire disparaître les symptômes en quelques jours. Des antalgiques peuvent également être pris pour soulager les maux de gorge ou la fièvre.
Autres données
Coronavirus et grippe
La co-infection par le SARS-CoV2 et le virus de la grippe est possible, bien que l’on ne sache pas encore très bien quels sont les effets de l’association des deux infections. La circulation du virus grippal était très faible en 2021, mais en 2022, davantage de cas et de co-infections ont été observés.
Pronostic de l’infection par coronavirus
La probabilité de survie du patient dépendra du type de coronavirus contracté :
- Les coronavirus du rhume présentent des taux de guérison très élevés et presque tous les patients parviennent à vaincre le virus en quelques jours.
- Les coronavirus du SRAS se dépassent aussi dans la majorité des cas, mais entre 9 et 12 pour cent des cas entraînent le décès du patient. Les patients jeunes ont davantage d’espoir de vie, car leurs symptômes sont généralement plus légers.
- Le taux de survie du MERS est moins élevé, atteignant environ 36 % de mortalité, selon l’OMS.
- Étant donné que la transmission du SARS-CoV-2 est largement supérieure à celle des épidémies précédentes, le nombre de décès est aussi beaucoup plus élevé. Le vieillissement et les pathologies chroniques (hypertension, maladie coronarienne, maladies respiratoires, cancer, diabète) constituent les principaux facteurs de risque associés à une plus grande gravité et létalité de l’infection par le SARS-CoV-2. Cependant, des cas graves et des décès ont aussi été observés chez des enfants et des jeunes sans conditions préexistantes.
On a identifié des symptômes qui peuvent indiquer un bon ou un mauvais pronostic de l’infection par le nouveau coronavirus. L’association de fièvre, toux et difficultés à respirer est généralement associée à un pronostic plus défavorable, tandis que la perte d’odorat tend à être un signe indiquant une évolution plus favorable.
Par ailleurs, de nombreux patients présentent des séquelles après avoir surmonté la maladie et d’autres souffrent de ce qui est appelé le Covid persistant. La Société espagnole de médecins généralistes et de médecine familiale (SEMG) a établi une guide clinique pour la prise en charge des patients souffrant du Covid persistant.
Variantes
Bien que le SARS-CoV-2 ne soit pas un virus d’une grande propension à la mutation, la pandémie a favorisé son évolution et des variantes – alfa, bêta, gamma, épsilon, delta, omicron – sont apparues et peuvent, entre autres, influencer l’efficacité des vaccins. La dernière variante préoccupante décrite a été l’omicron, beaucoup plus transmissible que les autres.
Bibliographie
- Déclaration commune sur la priorité de la surveillance de l’infection par le SARS-CoV-2 dans la faune sauvage et la prévention de la formation de réservoirs animaux. OMS (2022). https://www.who.int/es/news/item/07-03-2022-joint-statement-on-the-prioritization-of-monitoring-sars-cov-2-infection-in-wildlife-and-preventing-the-formation-of-animal-reservoirs
- Estimating excess mortality due to the COVID-19 pandemic: a systematic analysis of COVID-19-related mortality, 2020–21. Haidong Wang et al. (2022). The Lancet. https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)02796-3/fulltext
- Guía clínica para la atención al paciente long covid/ covid persistente. SEMG (2021). https://www.semg.es/index.php/consensos-guias-y-protocolos/363-guia-clinica-para-la-atencion-al-paciente-long-covid-covid-persistente
- Effect of Early Treatment with Ivermectin among Patients with Covid-19. Gilmar Reis et al. (2022). The New England Journal of Medicine. https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2115869
